可以冻结股权的部门包括：
人民法院：
在涉及诉讼保全或执行案件时，人民法院有权根据当事人的申请或者依职权对被告或者被执行人的股权进行冻结。例如，在债权债务纠纷案件中，如果债权人申请财产保全且有合理理由认为债务人可能转移股权逃避债务，法院经审查后可以冻结债务人在相关公司的股权。
市场监督管理部门：
在接到法院的协助执行通知书等相关法律文件后，会配合法院完成股权冻结在工商登记等相关事务上的操作，从而确保股权冻结的对外公示等相关工作得以完成。
公安机关：
在侦查犯罪过程中，公安机关可以依照规定查询、冻结犯罪嫌疑人的股权、保单权益和其他投资权益等财产，并可以要求有关单位和个人配合。冻结股权需要经县级以上公安机关负责人批准，并制作协助冻结财产通知书。
检察机关：
在刑事诉讼中，检察机关也有权查询、冻结犯罪嫌疑人的财产，包括股权。
税务机关：
在查处税收违法案件时，如果认为需要冻结纳税人股权来保证国家税款不流失，依据税收征管相关法律规定，也可以冻结股权，并通知相关的公司登记部门配合执行。
总结：
人民法院：负责在诉讼保全或执行案件中冻结股权。
市场监督管理部门：协助法院完成股权冻结的工商登记操作。
公安机关：在侦查犯罪时有权冻结股权，需经县级以上公安机关负责人批准。
检察机关：在刑事诉讼中可查询、冻结犯罪嫌疑人的股权。
税务机关：在税收违法案件中有权冻结股权。
